Экзотические молочайные крупным планом

В этом посте я разместил фотографии цветков пуансеттии (вверху) и другого представителя молочайных под названием снега Килиманджаро (снизу). На этих фотографиях видны мелкие цветки молочаных. Более красочное окружение представляет собой модифицированные листья, или бракты. Другие фотографии этих видов имеются в предыдущей записи.

Экзотические молочайные

Вот и кончился влажный сезон в Брисбейне. Не смотря на понижение температуры, в городе довольно много цветущих растений из числа иммигрантов. На верхнем снимке показана пуансеттия, или молочай красивейший (Euphorbia pulcherrima), а на нижнем, судя по всему, снега Килиманджаро,  Euphorbia leucocephala. В обоих случаях "цветы" представляют собой бракты (модифицированные листья), а сами цветки довольно мелкие.

Экзотические молочайные - 2

Acalypha wilkesiana / Toowong, Brisbane / Fuji X10 / December 19, 2011

По русски этот род называется лисохвост, но конкретно для этого вида русское описание в вики я не нашел. Любители тропических растений используют кальку с английского, Акалифа Уилкса. На фотографии - окультуренная разновидность Fijian Fire Plant (Copperleaf), весьма популярное растение у местных садоводов. Родина этого растения - остров Фиджи и прилежащие острова. Я очень удивился, узнав, что это растение из семейства молочайных (Euphorbiaceae). Красные цветы в центре кадра - женские, а мужские - снизу, в зеленом соцветии. Фрагмент фотографии с женскими цветками снизу.

Экзотические молочайные

Macaranga tanarius, из семейства молочайных / 30 декабря 2011

В конце декабря я сфотографировал некое растение, очень похожее на лиану. Сначала я решил, что это Stephania japonica, у которой тоже щитовидные листья (то есть черешок прикреплен не к краю листа, а к самой листовой пластинке, как на фотографии). Причем у одного подвида S. japonica цвет листьев снизу и сверху довольно сильно различается. Каково же было мое удивление, когда мне подсказали, что это Macaranga tanarius из семейства молочайных (Euphorbiaceae), и по идее растение должно представлять собой либо куст, либо маленькое дерево. Надо сказать, что на привычный мне молочай растение мало похоже, разве что цветки похожего цвета.

Современное родовое название в русском разделе вики отсутствует, но гугль нам подсказывает, что по русски это растение называется макаранга зонтиковая. Раньше этот вид относился к роду клещевины и назывался Ricinus tanarius L., то есть был описан еще Линнеем, и можно ожидать, что у него есть и другое русское название. Впрочем, родовое название у этого вида менялось несколько раз, да и видовое тоже.

С англоязычными названиями тоже путаница. В Штатах макарангу называют parasol leaf tree, а в Австралии используют различные названия типа Bullocks Heart, Nasturtium tree, (Blush) Macaranga, David's Heart, Heart Leaf. 

Щитовидный лист Macaranga tanarius

 Цветки Macaranga tanarius невзрачно желто-зеленого цвета.

Смолосемянниковые

Auranticarpa rhombifolia / Брисбейн, 9 февраля 2012 / flickr

Разнообразие растительного мира в Брисбейне приводит меня в состояние, очень похожее на депрессию. Растений тут много, и многие растут только в Австралии. Кроме того, в городе довольно много деревьев и кустарников, завезенных совсем недавно. Соответственно, практически все, что бросается в глаза на улице, оказывается африканским или южно-американским видом. С другой стороны, очень сложно различать некоторые виды эвкалиптов, особенно по фотографии.

Вот недавно сфотографировал в маленьком городском парке дерево с невероятным количеством оранжевых плодов. Не смог правильно определить даже семейство, так как плоды очень похожи. Знающие товарищи подсказали, что это Auranticarpa rhombifolia из сеймейства  Pittosporaceae (Смолосемянниковые или Питтоспоровые), который входит в порядок Зонтикоцветные (Apiales). То есть из известных мне растений "близкими родственниками" этому дереву будет морковка, укроп и аралия.  

Да и сам род Auranticarpa выделили относительно недавно, и раньше это растение называлось Pittosporum rhombifolium, то есть называлось смолосемянником. А для Auranticarpa руссокой записи в  wiki нет. 

Auranticarpa rhombifolia / Брисбейн, 9 февраля 2012 / flickr

Закат с летающими лисицами

Летающие лисицы на закате / 23 февряля 2012 / flickr

В последние дни в Брисбейне часто случаются очень красивые закаты. Длятся такие представления всего несколько минут, и цвета все время меняются. В этот раз у меня была Fuji X10. Фото сделано в "закатном" режиме. Кадр немного обрезан в ГИМПе. Летающие лисицы (Pteropus sp) видны на бОлешей картинке (можно кликнуть).

О базах данных и людях, их создающих

Я по образованию биолог, точнее, генетик, но сейчас в основном занимаюсь обработкой данных, можно сказать, биоинформатикой. Понадобилось мне скачать данные по изменчивости генома человека, доступные из проекта под названием 1000 человеческих геномов. (надо было назвать 1001, было бы лучше). Где-то 30-40 миллионов известных вариантов, с частотами. Ну, естественно, пошел на сайт проекта.

Самый свежий релиз/набор данных известен под именем Октябрь 2011. Его тогда и выпустили. Так вот ссылка на сайте идет на директорию 20110521 (май 2011), и конечно же, майский выпуск данных тоже был. А в названии файлов присутствует 20101123. Ага, 2010 год, ноябрь. Именно этот набор (Ноябрь 2010) я сейчас и использую, вместе с майским от 2011. На сайте так же указана дата создания файлов: декабрь 2011. Ну и файле README написано, что данные по инделам пока можно использовать на свой страх и риск. 

О повторяемости

 Заметил, что я снимаю одни и те же места из года в год. Вот и в этом году я повторил фотографию папоротника Asplenium australasicum в национальном парке Ламингтон.

Компьютерный перевод

Сетьевой перл компьютерного перевода:

Пользовался каждый бит вашу статью сообщение. Продолжайте писать.

Или вот еще:

Прямо здесь, Это уже третий просочились изображения для вас, ребята, Благодаря нашему читателю, который способствовал нас. Большое спасибо Эдо из Японии! Мы не можем реально сделать, что же в этой картине, похоже, есть объектив прилагается к нему, а также с ее сцепление.

За науку

Так уж случилось, что последние пару лет я работаю в новой для меня области науки, и в это время я не очень внимательно следил за литературой по сравнительной геномике и некодирующей РНК. Похоже, что обе темы стали невероятно популярны.

Сейчас я начитываю литературу по малым транскриптам в промотерах эукариот. У меня складывается впечатление, что значительная часть промотеров эукариот транскрибируется в обе стороны, и, кроме того, в этих районах находят разнообразные короткие РНК. Функция для большинста таких РНК не очень понятна.

Вот, например, статья Antisense RNA polymerase II divergent transcripts are P-TEFb dependent and substrates for the RNA exosome by Flynn et al.,  2011, PNAS 108:10460-10465. В ней авторы анализируют промотерные районы четырех генов в эмбриональных стволовых клетках мыши. Для каждого гена они охарактеризовали короткие РНК, транскрибирующиеся в противоположенную сторону от основного транскрипта (upstream antisense transcription in regions encoding transcriptional start site associated RNAs). Начинаются такие транскрипты примерно в 200-250 нуклеотидах от старта основного кодирующего транскрипта. Судя по приведенным аргументам, такие транскрипты имеют "кэп" на 5' конце, а 3' конец у них различный, так что длина транскриптов варьирует от примерно 50 до 1000 нуклеотидов. Авторы уверяют, что такие транскрипты присутствуют в 1-4 копиях на клетку (это довольно много, особенно если сравнивать с мРНК). Авторы так же показывают, что такие транскрипты зависят от белков, влияющих на остановку (pausing), а так же от активности РНК экзосомы.

Подводя итоги месяца

Уже месяц я веду английский блог. За это время набралась следующая интересная для меня статистика:
~ 20% "посещений" приходится на долю российских ботов;
~ 20% просмотров страниц приходится на долю ироничного поста о пересветах в виде белых кругов в одной моей фотографии, сделанной на Fujifilm X10.

Животные Австралии

Паук-охотник (huntsman) и геккон. Снято ночью в в Брисбейне, во время влажного сезона.
Местное название паука: Brown Huntsman Spider, Heteropoda jugulans. Ящерица: Asian House Gecko, Hemidactylus frenatus. Эти гекконы появились в Австралии относительно недавно, и значительно потеснили местные виды. 11 января 2012 года.

Кумера

В национальный парк Ламингтов ведут две дороги. Одна приводит к Зеленым горам (O'Reilly's), вторая доходит до Бинна Барры (Binna Burra). В Бинна Барре лес довольно влажный, сильно заросший колючими лианами, такими как Calamus muelleri, с большим количеством различных эпифитов, включая папоротники из рода Asplenium, например, костенец южноазиатский, A. australasicum, именуемый тут птичьим гнездом. Эта фотография сделана на маршруте вдоль реки  Кумера (Coomera).

О бложестве

Изучив статистику посещения блога, выяснил, что ко мне заходит только какой-то бот, разносчик спама. Вот только читать он вряд ли умеет. А если бы и умел, то и что с того?